品質の話と、処理のエラーの話を分けて書きますね。
品質という意味では、Flatに対するDarkは必須です。DarkによってCalibrationをしないと、Lightファイルに暗電流ノイズがのるため品質が悪化します。
エラーという意味では、FlatにDarkがなくても実行はできます。今回の例では180秒のDarkが登録されていたので、10秒のFlatに対して180秒のDarkでCalibrationをかけにいったのでエラーになっているものと思います。ただエラーの理由がそれなのか確証はもてないのですが、おそらくそうだと思います！
実行してまた結果をお教えください。