何度も申し訳ありません。
早速Distortioコンポジットn correctionにチェックを入れて走らせてみましたが、すこしづつ最終画像は異なりますが、位置合わせがうまくいっていない画像が出力されます。。また輝点ノイズもかなり残っています。同じ素材でステライメージを使えば問題なくきれいにインテグレーション（コンポジット）できています。なにか設定パラメーターの問題だとは思うのですが・・・。可能性のありそうなことは何でもしてみたいと思います。何か更に改善の可能性のありそうなことがあれば・ご指示いただければ幸いです。ご多忙なところ本当に申し訳ありません。