こんにちは
Test1とTest3に縮緬ノイズが出ていないとしたら、原因はマスターフラットにあることになります。
ただ、Test1とTest3はフラット補正をしていないのでSTFのオートストレッチのかかり方が弱く、縮緬が目立っていないだけかもしれません。Test1とTest3の画像で中心部の狭い部分をPreviewで切り取り、STFのオートストレッチをかけてみてください。それでも縮緬が見えなければ、フラットを取り直すことで解決できると思います。反対にもし縮緬が残っていれば、さらに検証が必要です。
マスターフラットはどのように取得していますか？
フラットパネルなど人口の光源を使っているなら、光源を明るくするか、一枚あたりの露光を伸ばすなどすれば、滑らかなフラットが得られて、縮緬が消えると思います。
スカイフラットをお使いなら、再取得は難しいと思うので、その場合はマスターフラットに数ピクセルのガウスボカシをかけてから適用すると縮緬が消えると思います。